Merge pull request #1044 from ScilifelabDataCentre/develop

send latest developments live

config.yaml

@@ -5,7 +5,7 @@ params:
   title: "The Swedish Pathogens Portal"
   description: The Swedish Pathogens Portal
   images:
-    - /img/site_logo/swe_pathogens_logo.png
+    - /img/swe_pathogens_social_media.png
 
   # There is a hugo i18n package, but it seems like overkill for so few strings
   lang_strings:

content/english/publications/_index.md

@@ -1,12 +1,14 @@
 ---
 title: Publications on COVID-19 and SARS-CoV-2
 menu:
-    research_menu:
-        identifier: publications
-        name: Swedish COVID-19 Publications
-        weight: 40
+  research_menu:
+    identifier: publications
+    name: Swedish COVID-19 Publications
+    weight: 40
 ---
 
-This section presents a list of published scientific journal articles and preprints on COVID-19 and SARS-CoV-2 where at least one author has an affiliation with a Swedish research institute. Note that this is a manually curated database and as such may not be exhaustive. If you would like your publication to be added here or information about your publication to be corrected, [please get in touch with us](/suggestions/). We also have a [page with visualisations of the publications in this database](/dashboards/covid_publications/).
+This section presents a list of published scientific journal articles and preprints on COVID-19 and SARS-CoV-2 where at least one author has an affiliation with a Swedish research institute. Note that this database is primarily a manually curated database and thus it may not be exhaustive. Note that from May 2023, we began to use the Europe PMC REST API to idenfy publications. The scripts that we use to do this are [openly available on GitHub](https://github.com/ScilifelabDataCentre/covid-portal-scripts/tree/main/All_publications) and can be reused with other pathogens.
 
-The full dataset of publications displayed on this page is available for download and use for other purposes. The dataset contains bibliographic information, abstracts, categorization into scientific fields, and manually curated links to the shared data related to each publication. Please see [DOI: 10.17044/scilifelab.14124014](https://doi.org/10.17044/scilifelab.14124014) for details.
+If you would like your publication to be added here or information about your publication to be corrected, [please get in touch with us](/suggestions/). We also have a [page with visualisations of the publications in this database](/dashboards/covid_publications/).
+
+The full dataset of publications displayed on this page is available for download and use for other purposes. The dataset contains bibliographic information, abstracts, categorisation into scientific fields, and manually curated links to the shared data related to each publication. Please see [DOI: 10.17044/scilifelab.14124014](https://doi.org/10.17044/scilifelab.14124014) for details.

content/svenska/publications/_index.md

@@ -2,6 +2,8 @@
 title: Publikationer om covid-19 och SARS-CoV-2
 ---
 
-I denna sektion presenteras en sammanställd kurerad lista över publicerade vetenskapliga artiklar och preprint rörande covid-19 och SARS-CoV-2. Minst en författare är affilierad till ett svenskt lärosäte. Sammanställningen görs manuellt och kan därför inte anses komplett. Om du saknar din vetenskapliga artikel eller vill förändra din vetenskapliga artikels sortering [kontakta vänligen oss](/sv/suggestions/).
+I denna sektion presenteras en sammanställd kurerad lista över publicerade vetenskapliga artiklar och preprint rörande covid-19 och SARS-CoV-2. Minst en författare är affilierad till ett svenskt lärosäte. Sammanställningen görs manuellt och kan därför inte anses komplett. Observera att vi från maj 2023 började använda Europe PMC REST API för att identifiera publikationer. Källkoden vi använder för att göra detta är [tillgänglig på GitHub](https://github.com/ScilifelabDataCentre/covid-portal-scripts/tree/main/All_publications) och kan återanvändas med andra patogener.
+
+Om du saknar din vetenskapliga artikel eller vill förändra din vetenskapliga artikels sortering [kontakta vänligen oss](/sv/contact/). Vi har även en [sida med visualiseringar av publikationerna i denna databas](/dashboards/covid_publications/).
 
 Den fullständiga sammanställningen av publikationer som visas på denna sida finns tillgänglig för nedladdning och användning för andra ändamål. Datasammanställningen innehåller bibliografisk information, sammanfattningar, kategorisering i vetenskapligt område samt manuellt granskad lista över länkar med tillhörande dataset relaterade till resp. publikation. Se [DOI: 10.17044/scilifelab.14124014](https://doi.org/10.17044/scilifelab.14124014).