Skip to content

marvin2022_A

filips edited this page Nov 29, 2022 · 2 revisions

GRUPA: 2022 A

Wstęp

  1. Pobieramy dokument - template do odpowiedzi
  2. Sprawdzamy strukturę, która została nam przydzielona (w formacie SMILES)
  3. Wypełniamy tabelę w nagłówku dokumentu odpowiedzi
  4. Odpowiadamy na pytania.
  5. Odpowiedzi wysyłamy na mój adres (do znalezienia tutaj)
  • ⚠️ typowe wartości pH w różnych obszarach przewodu pokarmowego pokazane są na rysunku na dole tej strony; proszę przyjąć dolne wartości zakresów.
  • ⚠️ po wysłaniu arkusza odpowiedzi (i upewnieniu się, że mail wyszedł z załącznikiem) należy skasowac wszystkie pliki związane z kolokwium z komputera (tj pulpitu, pobranych itp)
  • 💡 Wykonanie zrzutu ekranu: Ctrl+PrtScr

Życzę powodzenia! 👍

Zadania

Zadanie 1

Dla wskazanej cząsteczki proszę wyznaczyć:

  1. pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (załączyć rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych form w zależności od pH
  2. Czy związek ma szansę wchłaniać się w jamie ustnej, żołądku, jelitach? Odpowiedź krótko uzasadnić (1-2 zdania).
  3. Dla wartości pH typowych dla śliny, żołądka, jelita proszę:
    1. Policzyć logD w tych pH; podać wartości oraz załączyć odpowiednie wizualizacje
  4. Policzyć PSA (polar surface area 2D)
  5. Policzyć rozpuszczalność w wodzie:
    1. pokazać wykres zależności rozpuszczalności (w mg/ml!) od pH
    2. ile wynosi rozpuszczalność (mg/ml!) w pH śliny, żołądka, jelita?

Zadanie 2

  • Wyznaczyć kilka niskoenergetycznych konformacji cząsteczki ("conformers"), zapisać je w pliku SDF (w jednym pliku) (nie trzeba nic wklejać do dokumentu tekstowego)

pH

(Za: Review of in vitro digestion models for rapid screening of emulsion-based systems, David Julian McClements and Yan Lia, Food Funct., 2010,1, 32-59)

Clone this wiki locally